Pouco a pouco, os aplicativos de chamada de táxi estão incorporando soluções de pagamento móvel, cuja intermediação gera para eles uma receita extra. Um dos acordos mais recentes foi feito entre 99taxis e PayPal. A solução de pagamento móvel por cartão de crédito foi embutida no aplicativo de chamada de táxi. Para fomentar seu uso, as duas empresas estão oferecendo R$ 5 de desconto em todas as corridas do 99taxis que forem pagas com PayPal. A promoção vale para o Brasil inteiro até o dia 30 de setembro, mas está limitada a 109.200 corridas, o que acontecer primeiro. Isso significa um investimento de até R$ 546 mil para arcar com essa promoção, se ela for um sucesso. A longo prazo, a meta do 99taxis é de que 50% das suas corridas sejam pagas via PayPal.
A pré-autorização do pagamento é feito no começo da corrida. Quando alcançado o destino, mesmo que o celular do passageiro esteja sem sinal, o pagamento é concluído bastando digitar os três primeiros números do CPF no smartphone do motorista. Não há qualquer compartilhamento dos dados do cartão com o taxista.